理论上的多肽净含量(假设反离子是肽样品中唯一的非肽成分的前提下计算)可以将该多肽的分子量除以该分子量和用于中和该多肽所需的一些三氟乙酸或醋酸盐反离子之和乘以TFA三氟乙酸反离子分子量(mw=114)和AcO- 反离子分子量(mw=59)。例如,一个合成多肽的MW=1000,含有一个游离的N端氨基,一个Lys残基,理论上的多肽净含量为1000/(1000+(2 x 114))=1000/1228=0.81或81%。反离子并不是肽样品中唯一潜在的非肽成分。它还可能含有残留的水,吸附的溶剂和其他物质的痕迹。因此,实际净肽含量通常由元素分析(氮含量)或氨基酸的定量分析来确定。
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